妊娠週数の数え方について教えてください

最後の生理が10/9～10/15（その前が9/6～9/12）で、周期は平均32日です(23～45日とバラツキはあります）。生理がこなくて妊娠判定をしたところ陽性で、11/21に病院にいったところ妊娠は間違いなくしているが子宮に見えないので子宮外妊娠の可能性があると言われました。ふつうに考えるともう5～6週目なので見えてもいいはずとのことでした。　
性交渉をしたのが11/4なのですが、それでも5～6週目ということになるのでしょうか？　色々と素人なりにインターネットで調べたのですが自分が何週目で、あとどれくらいたったら見えて当然なのかがよけいにわからなくなってしまいました。教えていただければと思います。