おちんちんが埋まって短くなっています

生後9カ月半の息子は、1カ月児健診のときに睾丸が下りていないこと、おちんちんが体の中に埋まりやすいことを指摘されました。
いずれも「そのうち治る」とのことで、不潔にならないように押し出して洗うことを指導されたので、そのようにしていました。しかし、生後9カ月半になって睾丸は定位置に下りてきましたが、おちんちんは出てきません。
生まれたときには2～3cmくらいの長さだったのに、今は、縮んでいるときには1cm弱しかありません。おしっこが溜まっているときには、出ているようです。
このままでは、将来的に包茎になってしまうのでしょうか？　どのような対処をすればよいのでしょうか？