月に２回ほど発熱を繰り返しています

２カ月前から繰り返す発熱の原因についてですが、これまでの発育の様子や普段の生活、さらにこの２カ月の間の環境の変化などの情報がないため、この場ではきちんとした回答ができません。ぜひ入院時の担当医や普段診てくださっている医師に質問し、説明を受けるようにしてください。
肺炎で入院した時には血液検査をしているでしょうから、検査結果から発熱を繰り返しやすい原因となるものがあるのかどうか質問されてもいいと思います。肺炎で入院した後は、退院しても肺はすぐには元通りにはならないので、風邪をひくと気管支炎や肺炎になりやすいです。あせらずしっかりと治してください。