室内犬と子どもとの接し方は？

3ヶ月の息子のママです。室内犬を2匹飼っています。
息子が生まれるまでの3年間、犬たちは大人と一緒にベッドで寝たり、自由気ままに過ごしていました。現在は、私と息子は別の部屋で寝ているのですが、起きているときは犬と同じ部屋で生活しています。
息子は今、1日のほとんどをベビーベッドで寝ていますが、これからハイハイやつかまり立ちをするため、抜け毛や舐められたりすることの影響が心配です。
犬は、ミルクの匂いがする赤ちゃんを舐めたがると言います。最近、息子が指しゃぶりをするので衛生的にも良くないのでは、と心配になっています。室内犬とはいえ、息子がもう少し大きくなるまでは、なるべく一緒にさせない方が良いでしょうか？
犬たちもゲージに入れると吠えるため、今は自由にさせています。