ミルクの飲ませ過ぎで太り気味になってしまったのでしょうか？

おおよその目安として、生後3カ月までの体重増加は月1kgです。出生体重がわからないのですが、1カ月健診時で3,472gですと、生後2カ月で5,500gというのはいくぶん多いですね。ただし女の子の場合で1カ月健診時に身長が55cmというのは背が高いほうなので、身長に見合うだけの体重であれば太り過ぎではありません。また現在飲んでいる育児用ミルクの量も、現在の体重から考えて特別多いものではありません。母子健康手帳に発育曲線がついていますので、それに計測した体重と身長をプロットし、発育曲線のカーブに沿って成長しているかどうか、体重と身長のバランスを見てみてください。多分大丈夫だと思います。