インフルエンザと副鼻腔炎の処方薬の影響が心配です

妊婦8ヶ月でインフルエンザにかかり、治ったと思ったら副鼻腔炎にかかりました。抗生物質と痛み止め（頭や体全体が痛むため）が処方されましたが、なかなかよくならず、1週間ほど症状に苦しみました。
このところだいぶ落ち着き、回復してきましたが、処方された薬は最後まで飲むべきなのでしょうか？　薬剤師さんに処方薬の胎児への影響について尋ねたところ、完全に安全とも言いきれないようで、なるべく飲まない方がいいのかなと感じてしまいます。